Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Htatsf1Q8BGC0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms