Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Cracr2bQ80ZJ8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Cracr2bQ80ZJ8 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms