Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Amigo1Q80ZD8 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Amigo1Q80ZD8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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