Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Ttc28Q80XJ3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ttc28Q80XJ3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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Ttc28Q80XJ3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ttc28Q80XJ3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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