Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NischQ80TM9 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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