Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dsg1bQ7TSF1 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Dsg1bQ7TSF1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms