Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sys1Q78S06 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms