Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LcorQ6ZPI3 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
LcorQ6ZPI3 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms