Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Ccdc88cQ6VGS5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ccdc88cQ6VGS5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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