Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atp8b3Q6UQ17 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atp8b3Q6UQ17 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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