Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CtifQ6PEE2 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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