Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vstm2lQ6PDS0 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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