Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Tpm4Q6IRU2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Tpm4Q6IRU2 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
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