Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarca2Q6DIC0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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