Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tfe3Q64092 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tfe3Q64092 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms