Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Defa17Q64016 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Defa17Q64016 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms