Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
PatjQ63ZW7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms