Protein–RNA interactions for Protein: Q61657

Hes3, Transcription factor HES-3, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hes3Q61657 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hes3Q61657 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hes3Q61657 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hes3Q61657 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hes3Q61657 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Hes3Q61657 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hes3Q61657 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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