Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde3bQ61409 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pde3bQ61409 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms