Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Rbbp4Q60972 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms