Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cnot7Q60809 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cnot7Q60809 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms