Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Csnk2a1Q60737 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Csnk2a1Q60737 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csnk2a1Q60737 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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