Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Samhd1Q60710 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Samhd1Q60710 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms