Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Prdm1Q60636 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Prdm1Q60636 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Prdm1Q60636 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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