Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sft2d1Q5SSN7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms