Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ncor2-201ENSMUST00000055256 7780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Trappc1Q5NCF2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms