Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Trim58Q5NCC9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim58Q5NCC9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
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