Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Fam208bQ5DTT3 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
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