Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Znf48Q3US17 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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Znf48Q3US17 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Znf48Q3US17 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms