Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Tmem253Q3UNB8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.3 ms