Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ccdc34Q3UI66 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc34Q3UI66 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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