Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Kdm4dQ3U2K5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms