Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms