Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Srsf6Q3TWW8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms