Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Fndc4Q3TR08 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms