Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm10764-202ENSMUST00000220397 2335 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ccbe1Q3MI99 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Gp1ba-202ENSMUST00000108551 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ccbe1Q3MI99 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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