Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Fam178bQ24JP3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms