Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rpusd2Q149F1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rpusd2Q149F1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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