Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vps8Q0P5W1 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms