Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kcnma1Q08460 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnma1Q08460 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnma1Q08460 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
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