Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Cdx4Q07424 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms