Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdf3Q07104 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms