Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sh3bp2Q06649 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sh3bp2Q06649 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
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