Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Cab39Q06138 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms