Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Cxcr5Q04683 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms