Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Msx2Q03358 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms