Protein–RNA interactions for Protein: Q03347

Runx1, Runt-related transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx1Q03347 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Runx1Q03347 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Runx1Q03347 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms