Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Nme2Q01768 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms