Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EgfrQ01279 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
EgfrQ01279 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
EgfrQ01279 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms