Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Grin2bQ01097 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms